来源的调查综述 (初稿)

作者:赵盛烨

2021年1月22日

目 录

摘要1

第1章 绪论1

第2章 病毒的自然进化2

2.1 自然变异2

2.2 自然嵌合3

2.3 逻辑计算4

第3章 人工嵌合病毒研究5

3.1 研究团队介绍5

3.2 研究成果介绍5

3.3 本章小结16

第4章 关系分析17

第5章 安全风险19

5.1 违背政府要求进行研究19

5.2 不遵守生物实验规范20

5.3 向不可控的第三方分享科学成果20

5.4 安全风险连带事件21

5.5 本章小结23

第6章 结论与思考23

附录24

参考文献24

致谢25

摘要

2019年开始,新型冠状病毒的爆发对全人类的生命安全带来了极为严重的威胁,随之而来的是各国政府和民众对病毒来源的猜测。但病毒的追踪溯源是一个严肃的科学问题,不能只依靠推测和推断就能锁定起源,也不能一开始就以“阴谋论”的思维限定于人工制造,更不能不经过调查就将病毒的来源臆测为自然产生,以上无论哪一种思维都是不尊重科学的不严谨行为。

因此作者站在公正的第三方角度上检索科研资料及能够采信的新闻信息,同时抛开与政治和舆论相关的内容。作者不会首先预设结论,然后再基于各方面的科学研究方法进行理智客观的分析,从而使本文的结论确凿可信。

文章首先以世界最新的病毒学理论研究为基础,在分子生物学的相关知识指导下建立了冠状病毒RNA自然变异和进化的理论模型,并依照该理论模型计算SARS-Cov病毒进化为SARS-Cov-2(即COVID-19)病毒的概率,分别通过RNA分子单碱基突变和自然嵌合突变的计算,得出了病毒来自人工嵌合的概率结果。

在病毒来自人工嵌合的概率结果基础上,作者通过对病毒学期刊、论文的检索,综述了人类科学家目前最顶级的研究成果,并通过对这些成果的分析,进一步建立了科研社会关系模型。

在科研社会关系模型的基础上,作者依照显而易见的逻辑分析和现实事件对比,揭示了不遵守科学研究职业道德和相关规章制度所带来的严重后果,从而警示人类科学家应进一步恪守底线,通过严谨踏实的科学求证过程造福人类社会。

【关键词】COVID-19, SARS-Cov-2, 新型冠状病毒, 病毒溯源, 疫情分析, 病毒学基础

第1章 绪论

“人类生存在地球上,地球孕育并繁衍了人类,从大约50亿年前,这颗星球逐渐形成,便开始了孕育生命的准备过程,今天的人类离不开地球,今天的地球也离不开人类。然而这一些都是人类的主观观点,事实上如果地球上没有人类,也许一切会更美好。”曾经有一位外国朋友如是对作者说。

作者完全不赞同这位朋友的观点,因为也许没有人类的地球不会更糟糕,但是没有人类的地球一定不会更美好,因为如果我们都不在了,谁还能来判定美好呢?人类与地球是相互依存的关系,地球的灾难就是人类的灾难,人类的灾难也是地球的灾难。地球上各个国家的人类只有互相求同存异,相互合作、相互交流、相互促进发展,这个地球才会更加美好。

没有人可以阻止人类命运共同体的发展,即便是神,那也不行。

公元2019年袭来的新冠病毒给人类带来了百年中的第一次瘟疫大流行,人类社会的经济、政治、文化都遭遇到了前所未有的严峻挑战。那么,新冠病毒是什么?这种病毒有什么特性?这种病毒到底来自于哪里呢?作者不预设结论的撰写本文,力图通过科学的方法和科学的过程解读新冠病毒,并解决病毒的溯源问题。

图1.1 COVID-19溯源流程及科学方法

第2章 病毒的自然进化

地球上的生命是多种多样的,既有土壤中极为微小的微生物,也有常见的动物和植物,而人类只是众多种类地球生命中的一种。尽管从历史上看,生物学家对于生命的分类有很多种划分方法,但从现代分子生物学角度来看,生命只有DNA生命和RNA生命两种,人类是前者,新型冠状病毒是后者。

DNA是脱氧核糖核酸,由ATGC四种碱基组成,RNA是核糖核酸,由AUGC四种碱基组成。无论是DNA还是RNA,都是生命的遗传物质,DNA生命中既包含DNA也包含RNA,RNA生命中只有RNA,与RNA生命相比,DNA生命因为包含的碱基数量较多,双链DNA(dsDNA)的遗传结构较为稳定,因此会显得相对复杂和高级。单链RNA(ssRNA)遗传结构不稳定,容易发生多种多样的变异。除了前文所述的内容,生命中也有单链DNA(ssDNA)和双链RNA(dsRNA),二者均不在本文的研究范畴内。

RNA当中四种碱基冗长的排列顺序决定了该遗传物质产生的蛋白质属性,其合成的蛋白质是多样的,这就包括有特定功能的蛋白质酶(Enzyme)。这种酶是大分子,它一般是由多肽键(氨基酸脱水缩合)构成的肽链(Peptide Chain),肽链通过其催化基团、结合基团及其在三维空间中的结构特点而具备各不相同的催化和表达特征。

正是基于前文论述的分子生物学原理,冠状病毒以其RNA为遗传载体,在传播、复制过程中分别产生了刺突糖蛋白(Spike Protein)、包膜糖蛋白(Envelope Protein)、膜糖蛋白(Membrane Protein)等。更具体的来看,被世界卫生组织(WHO)定义编号为“COVID-19”的新型冠状病毒,其传播特征是首先进入人体细胞,然后通过膜融合的“脱壳”过程将自身的RNA介入到人体细胞中,劫持人类细胞的遗传物质翻译过程,并利用人体内的物质合成大量RNA(-)和与病毒RNA完全相同的RNA(+),新合成的RNA(-)将依靠其全链当中的片段生成多种mRNA(+),mRNA(+)再生成新的蛋白,于是新蛋白与新生成的RNA(+)便可以共同组装出新的病毒,然后释放到被感染细胞周边空间的其他人类细胞当中,从而完成了病毒基因的复制和病毒增殖。

2.1 自然变异

本文所描述的病毒基因复制过程是绝大多数情况下所发生的过程,但我们一般认为其每一次RNA装配过程都因为细胞所处的物理学环境和化学环境因素影响,而产生差错的可能,例如一个基因测序片段为UCUGGG的RNA(+),其对应的RNA(-)为AGACCC,而在不稳定的复制过程中很可能变成了UCACCC,这样再生成RNA(+)时就会变为AGUGGG。这样的复制结果即为病毒发生了变异。尽管对单体病毒而言,变异发生的可能性是相对小概率的,但是在病毒具有一定基数的背景下产生变异的现象却是必然。(备注:UCUGGG序列来自于《Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag》论文对新冠病毒的RNA片段测序,其原文为TCTGGG,系因为当前地球人类科学家的测序仪不能对RNA中的U碱基进行识别,为了避免引起歧义并对RNA进行更科学的描述,本文将T替换回U进行了表述。)

当病毒RNA在复制过程中产生变异,其单个碱基可能变异为其它的碱基或者是被一组碱基替换,例如AGA可能变异为AAA、ACA、AUA或者AxA,其中x={ AGA ,AA,…},即x代表某一串碱基。因此设m为RNA的碱基测序长度,我们得出单个碱基变异为某一固定样式的概率为:

Pc(m)=1/(4^m)

以其中一个COVID-19病毒样本的RNA测序结果为例,其基因组序列是具有29903bp的单链RNA,得出在自然变异状态下取得单一碱基固定变异结果的概率为1/(2.5114277*10^18003),而2.5114277*10^18003是一个大到无法用文字读法描述的数值,因此这代表在如此众多的变异版本当中找到这个固定方向的自然变异病毒是一件几乎不可能的事情。

值得人类庆幸的是,病毒在复制过程中所产生的变异绝大多数都是无效或者无意义的,因为在多数情况下单个碱基的变化并不能改变其蛋白质的合成,因此具有变异碱基RNA的病毒个体遵循自然选择原理,其结局包括:(1)自然消亡;(2)携带变异点位继续保持相似的特性进行传播;(3)携带变异点位并产生新的特性进行传播并逐步消亡;(4)携带变异点位并产生新的特性进行传播并大范围扩散等。它们分别对应着残疾病毒、弱变异病毒、退化病毒、进化病毒,其中只有最为罕见的第4种情况会对人类带来更大的威胁。此外,人类科学家也经常利用病毒变异的原理建立病毒RNA族谱,根据不同的碱基变异点位确定病毒传播的路径和先后顺序。

2.2 自然嵌合

在自然界当中,生物之间的嵌合也是一种偶发的现象,这是对一种生物细胞携带了另一种生物细胞特性的总称,例如让马的子代含有驴子的特征,这一杂交过程就是生物嵌合的一种。而本文所引用的嵌合特指病毒RNA之间的遗传基因嵌合。

SARS-Cov病毒与HIV-1病毒同属于RNA病毒,当两种病毒同时感染了空间中相同的一个人类细胞以后,由于前文所述的病毒复制增殖过程,可能会在RNA复制期间产生装配错误,该装配错误属于自然变异的一种,即本文2.1章节中举例所指AGA变为AxA的过程中的一种特例。

2020年初,印度学者Prashant Pradhan(Kusuma School of biological sciences, Indian institute of technology)等人撰写了《Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag》一文,表达的思路是,在COVID-19病毒的刺突糖蛋白(S)中发现了4个嵌入点位,这是该病毒所独有的,其他冠状病毒中没有这些嵌入片段。重要的是,所有4个嵌入点位中的氨基酸残基均与HIV1gp120或HIV-1Gag中的氨基酸残基具有相同性或相似性。该文作者隐含的表述了有人使用了基因编辑技术将SARS-CoV的RNA进行了编辑,在其中插入了四段HIV病毒的片段,制造了SARS-CoV-2病毒。这四个片段的共同作用使SARS-CoV-2病毒比SARS-CoV的传播能力更强了。

随后,旅美华人(侨)Chuan Xiao(Department of Chemistry and Biochemistry, The University of Texas at El Paso, El Paso, TX, USA)等人撰写了《HIV-1 did not contribute to the 2019-nCoV genome》一文,认为这四个RNA片段不只是在HIV-1病毒中特有的,而且研究人员在2013年也发现了这几个片段存在于蝙蝠感染的冠状病毒当中,这证明印度学者所猜测的结果并不准确,于是Prashant Pradhan对论文进行了撤稿处理。

本文无意在双方的争执当中占有立场,但双方论文的研究过程及其中间数据均可以佐证一个事实,即与SARS-CoV相比,COVID-19(也称SARS-CoV-2)病毒新增了四个外源嵌入的RNA片段,尽管目前依然不能确定该四个片段是否直接来自于HIV-1型RNA病毒或者其它细菌,但是我们可以计算其自然产生的概率。

设嵌入4个RNA片段的事件为Q,被引入RNA来自于OTH生物体,蝙蝠或人类或骆驼等生物患有SARS-CoV的概率为P(SARS-CoV),两种病毒出现在相同细胞的概率为P(Cell),则有:

P(Q)= P(OTH)*P(SARS-CoV)* P(Cell)*Pc(m)^4

为了使公式说明的更直观,本文用思维实验的方式带入数据验证。

思维实验:设OTH生物体为蝙蝠自带,即设P(OTH)=1,用极限法扩大数据认为所有蝙蝠都携带这种基因,设P(SARS-CoV.bat)=1即用极限法扩大数据认为所有蝙蝠都携带有SARS-CoV病毒,同时还需要设两种基因存在于相同的蝙蝠细胞中,即P(Cell)=1,则有P(Q)= Pc(m)^4。基于本文2.1章节所述,病毒自然变异的概率Pc(m)的数值无限接近于0,则Pc(m)^4也是无限接近于0的结果。因此病毒在自然进化的角度上完成其具有该特征的自然嵌合进化也是一件几乎不可能的事情。

2.3 逻辑计算

逻辑运算是数学计算的重要组成部分,本文引入逻辑运算对与病毒进化相关的问题进行分析。

设SARS-CoV进化为COVID-19的事件为Event,则有:

PB(Event)=PB(A)∧PB(B)∧PB(Manmade)

其中A为非嵌合类自然变异、B为自然嵌合、C为人工嵌合,相当于(PB(A)∧PB(B))与PB(Manmade)为互斥事件,P(Q)∈Pc(m),则有:

PB(Event)= Pc(m) + PB(Manmade)

基于世界卫生组织已经确认了SARS-CoV向COVID-19的进化,则PB(Event)=1,为了最大程度的减少争议,本文放大PB(A)的数值到0.1%,按照本文2.2章节所述思维实验则有P(Q)= 0.000000000001。

由此可得PB(Manmade)=0. 998999999999,这个数值说明了人工嵌合病毒的概率大于99.9%,本文站在公正的第三方角度上进行分析,不会首先预设结论,在此基础上基于各方面的科学研究方法进行理智客观的分析,从而使我们的结论确凿可信。正是基于这样的思维,促使本文作者进一步在基因工程和病毒学研究领域进一步学习和研究,从而展开了其余篇章的论述。

第3章 人工嵌合病毒研究

在COVID-19病毒爆发的初期,很多中国研究人员认为人类不可能对RNA病毒进行基因改造或者培育,事实上这背离了辩证唯物主义中对于事物是不断变化发展描述的科学思维,也是一种无知的表现。

事实上,随着人类科学家对生物遗传基因认识的不断加深,冠状病毒的复制、翻译机制也逐渐明晰,通过人类现有的技术手段对冠状病毒基因进行克隆、改造、嵌合已经是一项成熟的技术,只是由于这项技术只掌握在美国少数几位科学家团队手中,才很少被世人所知。在新冠病毒爆发以后,我们重点学习了堪称“冠状病毒之父”的Ralph S. Baric教授之相关研究成果,为了避免引发歧义,本文将通过直接引述附加科学评价的方式叙述其人工制造RNA病毒的研究进展及相关方法。

3.1 研究团队介绍

依据国际惯例,本文在引述其研究成果之前,将介绍研究者的基本信息,以表尊敬。Ralph S. Baric教授,男,1954年出生于美国,微生物学专家,全球首席冠状病毒科学研究者,1977年本科毕业于北卡罗莱纳州州立大学,1983年硕博连读毕业于北卡罗莱纳州州立大学,1982至1986年在南加利福尼亚大学医学院微生物学和神经病学实验室从事博士后研究工作。1986年3月至1990年6月在北卡罗来纳大学教堂山寄生虫学和实验室任实践系助理教授,1990年7月至1993年6月在北卡罗来纳大学教堂山流行病学系任助理教授,1993年至2001年7月在北卡罗来纳大学教堂山分校流行病学系任副教授,1993年7月至2001年在北卡罗来纳大学教堂山微生物学和免疫学系任副教授,2002年7月至今在北卡罗来纳大学教堂山微生物学和免疫学系流行病学系任教授。

Baric教授的成就包括但不限于1987年获得美国杰出青年称号,1989-1994是美国心脏协会常设调查员,2004年成为《病毒学杂志》编辑委员会成员,2004年获得世界技术进步奖.病毒学B研究科常任成员,美国生物科学专家组(BSEG)成员,2009年入选美国太平洋西北区域英才中心内部咨询委员会成员,为美国国家科学院提供医学分级选择因子的基因序列方法研究,2010年成为美国科学院微生物学学院研究员。

Baric教授多年以来致力于冠状病毒的研究、克隆、基因改造工作研究,同时注重人员和团队的培养,为病毒研究领域培养了45位以上的高级研究人员,其中包括:德特里克堡美国陆军传染病医学研究所分子和转化科学处的Allison Totura(主攻SARS病毒方向)、美国陆军研究所逆转录病毒科的Sheila Peel高级研究员、美国联邦药物管理局的Damon Deming、美国退伍军人事务部的Matthew Friedman教授、美国食品和药物管理局(FDA)的Patrick Harrington、美国陆军传染病医学研究所的高级科学家Lisa Hensley、美国食品和药物管理局的Eric Donaldson博士等。

3.2 研究成果介绍

Baric教授自1983年以来,以自身名义,或者作为指导教师,总计发表400余篇论文,我们节选了部分论文及其摘要,以便于公众了解其在微生物领域所作的非凡贡献。本文作者使用机器翻译的方法对各个论文的摘要部分进行了翻译,没有充足的时间进行系统的人工校验,也有许多文字识别错误,不足之处将在未来版本中进行改善。

(1)1983年6月,Michael M.C.Lai,Chris D.Patton,RALPH S.BARIC,Stephen A.StoHLMAN等人撰文《Presence of Leader Sequences in the mRNA of Mouse Hepatitis Virus》,透露:“为了确定小鼠肝炎病毒mRNA的结构和合成机制,研究了7种小鼠肝炎病毒株A59细胞内mRNA物种的大RNaseTI耐药寡核苷酸的地图位置。我们发现,除了一个寡核苷酸之外,所有的寡核苷酸都被映射在每个mRNA中的位置上,这与小鼠肝炎病毒mRNA的嵌套结构、阶梯状结构一致(Lai等人,J.Virol。 39:823-834)。 然而,一个寡核苷酸,10,被定位在每个mRNA和病毒基因组RNA的5‘端附近。 换句话说,寡核苷酸10,因此,mRNAs的5‘端周围的序列与基因组序列不是共线性的。 由于这种寡核苷酸在基因组RNA中只存在一次,这一结果表明,寡核苷酸10不是从基因组模板上的多个位点转录的,而是代表在mRNA转录过程中连接到不同mRNA的体序列的一个先导RNA序列。 这为小鼠肝炎病毒(即细胞质病毒)的mRNAs中存在领导者序列提供了迄今为止最直接的证据。”在此后的多年里,Baric教授致力于这种冠状病毒的分子生物学研究,包括RNA的转录、翻译、蛋白质合成等研究,并以第一人称发表了数十篇高质量论文。

(2)1986年3月,SHINJI MAKINO,JAMES G. KECK, STEPHEN A. STOHLMAN, AND MICHAEL M. C. LAI等人撰文《High-Frequency RNA Recombination of Murine Coronaviruses》,指出“冠状病毒的RNA基因组由单个非分节RNA组成。 在这篇通讯中,我们证明了不同菌株的小鼠冠状病毒的RNA基因组在混合感染过程中以非常高的频率重组。 易感细胞与一株小鼠肝炎病毒(MHV)的温度敏感突变体和一株不同菌株的野生型病毒共感染。 在21种随机分离的病毒中,在不允许的温度下从共感染的细胞中释放出来,其中2种是重组位点不同的重组体。 在混合感染产生的原始病毒库的三个连续传代后,大多数后代病毒是重组体。 这些重组病毒代表了两个亲本MHV株之间至少五个不同的重组位点。 这种在MHV非分段RNA基因组之间的高频重组表明,在MHV复制过程中可能会产生分段RNA中间体。我们提出MHV的RNA复制以不连续和非连续的方式进行,从而产生游离的分段RNA中间体,可通过复制选择机制用于RNA重组。”Baric不是这篇文章的作者,但是他在该文发表之前对原作者进行了批评指正。

(3)1989年12月,RALPH S. BARIC,KAISONG FU,MARY C. SCHAAD,AND STEPHEN A. STOHLMAN等人撰文《Establishing a Genetic Recombination Map for Murine Coronavirus Strain A59 Complementation Groups》,指出:“采用基因重组技术分离并表征了MHV-A59温度敏感突变体,代表一个RNA和五个RNA互补基团。 最大重组频率发生在感染倍数大于10的情况下,其中99.99%的细胞被共感染。 不同TS突变体之间的重组频率在感染期间稳步增加,并在病毒生长周期的后期达到峰值。这些数据表明重组是病毒复制周期中的一个晚期事件。重组频率也被发现从63到20000倍以上的自发回归频率之和的每个TS突变体在交叉使用。利用标准的遗传重组技术,将MHV-A59的五个RNA互补基团排列成一个加性的、线性的遗传图谱,位于23酶区基因组的5‘端。 这些数据表明,至少有五种不同的功能编码在MHV聚合酶区,在病毒转录中起作用。 此外,使用特征良好的TS突变体,整个32kb的MHV基因组的重组频率接近25%或更多。这是描述的非分段、线性、加极性RNA病毒的最高重组频率。” 这是Baric首次在文章中正式提及基因重组对病毒的影响,也正是这篇文章开始了他在冠状病毒RNA领域的更深入研究。

(4)2000年5月,BOYD YOUNT,KRISTOPHER M. CURTIS, RALPH S. BARIC等人撰写了《Strategy for Systematic Assembly of Large RNA and DNA Genomes: Transmissible Gastroenteritis Virus Model》,介绍其团队“开发了一种组装大型RNA和DNA病毒功能全长基因组的系统方法。 冠状病毒含有自然界中最大的单链正极性RNA基因组。长度为30kb的基因组,再加上基因组不稳定的区域,阻碍了全长感染性cDNA结构的发展。构建了猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的完整传染结构。采用一种新的方法,分离了六个相邻的cDNA亚克隆,它们跨越了整个TGEV基因组。 每个克隆都是用独特的侧翼相互连接的连接来设计的,这决定了一个精确的系统组装,只有相邻的cDNA亚克隆,从而形成了一个完整的TGEVcDNA结构,长度为28.5kb。 来自全长TGEV结构的转录本具有传染性,子代病毒在允许的宿主细胞中连续传代。病毒抗原的产生和亚基因组mRNA的合成在感染和整个传代过程中都是明显的。从感染性结构中提取的菌斑纯化病毒有效复制,并在允许的宿主细胞中表现出相似的菌斑形态。 在猪和猫起源的细胞中,分子克隆病毒和野生型病毒的宿主范围表型相似。 重组病毒通过独特的相互连接连接的连接进行测序,最终证明了标记突变和限制性位点被设计成组分克隆。 TGEV的全长感染性结构将允许冠状病毒基因组的精确遗传修饰。 我们设计的产生TGEV传染性cDNA结构的方法在理论上可以用于精确重建长度接近数百万碱基对的微生物或真核基因组。”这是Baric首次提出这种可以改造病毒基因的方法。

(5)2001年5月21日,Ralph S.Baric,Haw River,NC(美国);Boyd Yount,Hillsborough,NC(美国)等人为《DIRECTIONAL ASSEMBLY OF LARGE VIRAL GENOMES AND CHROMOSOMES》申请了美国国家专利(US006593111B2),专利涉及到“大型基因组的定向组装,更具体地说,涉及大型病毒基因组的定向组装”,系全长的、功能完整的基因组或染色体与基因组的部分cDNA或DNA亚克隆定向组装。这种方法促进了基因组和染色体在体外的重构,以重新导入到一个活的宿主,并允许选择的诱变剂ESIS和遗传操作的序列在体外重新组装成一个完整的基因组分子,以重新导入到相同或不同的宿主。这种方法还提供了一种替代重组介导的技术Niques来操纵高等植物和动物以及细菌和病毒的基因组。该专利不限于组装全长的功能性冠状病毒基因组。目前的发明者已经成功地组装了一种传染性胃肠炎病毒(TGE)的全长传染性克隆)。采用一种新的方法,分离了六个相邻的cDNA亚克隆,它们跨越了整个TGE基因组。 每个克隆都是用独特的侧翼相互连接的连接来设计的,这决定了一个精确的、系统的组装,只有正确的相邻的cDNA亚克隆,从而形成了一个完整的TGECDNA结构,长度约为28.5kb。从全长TGE结构中提取的转录本被发现具有传染性,后代病毒在允许的宿主细胞中连续传代。 病毒抗原和亚基因组m RNA的合成在感染和整个传代过程中都是明显的。 从感染结构中提取的菌斑纯化病毒被发现在允许的宿主细胞中有效地复制。 重组病毒被测序为独特的相互连接的连接,最终形成了独特的标记突变和限制性位点,这些位点被设计成组分克隆。 除其他优点外,TGE的全长传染性克隆每个MIT的冠状病毒基因组的精确遗传修饰。该专利于2003年7月获得授权。此后几年,Baric一直致力于多种冠状病毒RNA的基因重组、嵌合研究。

erts, Damon Deming , Christopher D. Paddock , Aaron Cheng , Boyd Yount, Leatrice Vogel, Brian D. Herman1 , Tim Sheahan , Mark Heise, Gillian L. Genrich , Sherif R. Zaki , Ralph Baric, Kanta Subbarao发表论文《A Mouse-Adapted SARS-Coronavirus Causes Disease and Mortality in BALB/c Mice》,论文指出“严重急性呼吸综合征(SARS)的单一动物模型无法再现人类疾病的各个方面。年轻的近交系小鼠支持SARS冠状病毒(SARS-CoV)在呼吸道的复制,并且有足够的数量用于统计评估。它们相对便宜并且容易获得,但是它们在SARS研究中的应用是有限的,因为它们不会在感染后发展成疾病。年龄较大(12-14个月大)的BALB/c小鼠会出现临床疾病和肺炎,但很难获得,免疫衰老使发病机制研究复杂化。我们通过在年轻BALB/c小鼠呼吸道中连续传代来适应SARS-CoV(Urbani株)。15代产生了一种病毒(MA15),经鼻接种后对小鼠是致命的。在致死之前,病毒在肺部迅速和高滴度复制,病毒血症,病毒传播到肺外部位,并伴有淋巴细胞减少、中性粒细胞增多和肺部病变。丰富的病毒抗原广泛分布于支气管上皮细胞和肺泡肺细胞,坏死的细胞碎片存在于气道和肺泡中,只有轻度和局灶性肺炎。这些观察结果表明,感染MA15的小鼠死于一种压倒性的病毒感染,病毒介导的肺细胞和纤毛上皮细胞广泛破坏。MA15病毒有6个编码突变,与适应性和毒力增加有关;当引入重组SARS冠状病毒时,这些突变导致高毒力和致命性病毒(rMA15),复制了生物衍生的MA15病毒的表型。鼻内接种MA15可复制严重人类SARS病例中所见疾病的许多方面。MA15病毒的可用性将增强SARS小鼠模型的使用,因为感染MA15会导致发病率、死亡率和肺部病理学。”这也是2020年社会广泛争议的“MA15”嵌合基因的最早来源。

(15)2012年4月,Jeremy Huynh, Shimena Li, Boyd Yount, Alexander Smith, Leslie Sturges, John C. Olsen, Juliet Nagel, Joshua B. Johnson, Sudhakar Agnihothram, J. Edward Gates, Matthew B. Frieman, Ralph S. Baric , Eric F. Donaldson等人发表论文《Evidence Supporting a Zoonotic Origin of Human Coronavirus Strain NL63》,指出“自2005年在中国马蹄蝠中发现SARS样冠状病毒以来,蝙蝠与冠状病毒的关系受到了广泛关注。从那时起,全世界有几只蝙蝠被证明在粪便中脱落了冠状病毒序列,可能还有冠状病毒;然而,没有一只蝙蝠冠状病毒从自然界中分离出来。此外,很少有蝙蝠细胞系或试剂可用于研究蝙蝠细胞中的CoV复制或用于分离适应特定蝙蝠物种的bat-CoV。在这里,我们通过分子钟分析表明,来自北美三色蝙蝠的α冠状病毒(_x005f_x0001_-CoV)序列被预测与人类CoV(HCoV)-NL63具有共同祖先,这些病毒之间最近的共同祖先大约发生在563至822年前。此外,我们从这种蝙蝠的肺中培养出永生化蝙蝠细胞系,以确定这些细胞是否能够支持HCoVs的感染。当SARS-CoV、小鼠适应的SARS-CoV(MA15)和带有早期人类毒株尖峰基因的嵌合SARS-CoV复制效率低下时,HCoV-NL63在这种蝙蝠的永生化肺细胞中复制了多次传代。这些观察结果支持这样的假设,即人类冠状病毒能够建立人兽共患病的反向人兽共患病传播循环,使某些冠状病毒能够在蝙蝠和包括人类在内的其他哺乳动物的毒株之间容易地循环和交换遗传物质。”论文表明,Baric团队一直致力于研究冠状病毒跨物种传播的相关原理,在世界范围内广泛收集可能导致新型冠状病毒向人类传播的方式方法及相关证据。

(20)2015年9月,Vineet D. Menacherya , Boyd L. Yount Jr.a , Amy C. Simsa , Kari Debbinka,b, Sudhakar S. Agnihothramc , Lisa E. Gralinskia, Rachel L. Grahama , Trevor Scobeya , Jessica A. Plantea , Scott R. Royala , Jesica Swanstroma , Timothy P. Sheahana, Raymond J. Picklesc,d, Davide Cortie,f,g, Scott H. Randelld , Antonio Lanzavecchiae,f, Wayne A. Marascoh, and Ralph S. Baric发表论文《SARS-like WIV1-CoV poised for human emergence》,认为“人畜共患疾病的爆发对人类疾病和全球经济都构成了威胁。尽管有大量的宏基因组学研究,利用这些数据集来确定未来威胁的方法还不成熟。在这项研究中,我们描述了一种方法,结合现有的宏基因组数据和反向遗传学工程试剂,以评估出现和潜在的致病循环人畜共患病毒。以严重急性呼吸综合征(SARS)样病毒为研究对象,结果表明WIV1冠状病毒(CoV)簇具有直接感染的能力,在人群中的传播有限。然而,体内衰减表明流行病需要额外的适应。重要的是,现有的SARS单克隆抗体在限制病毒感染方面取得了成功,而现有的疫苗方法却没有。” 这篇文章是在美国政府因安全问题停止了SARS研究经费赞助的情况下进行的。该论文是人类首次对WIV1的尖峰蛋白和野生SARS-Cov进行嵌合实验,同时根据RNA序列研究显示,现有的COVID-19病毒具有SARS-Cov和WIV尖峰蛋白的共同特征,是否起源于本次实验或本次实验的后续实验则有待调查。

(25)2019年年末,中国科学家正式检测到新型冠状病毒(COVID-19或SARS-Cov-2)的爆发。

3.3 本章小结

Baric教授及其团队近40年以来致力于冠状病毒的研究工作,拥有众多的研究成果及知识产权,其发明的多种病毒嵌合改造方法既可以用于研发新型病毒,也可以用于以实验为目的的人工病毒制备工作。以编号为US007618802B2及编号为WO 2005/035712 A2的专利为例,均有美国马里兰州德特里克堡的人员被列为共同发明人,这种做法更有利于隐蔽式的分享专利,使德特里克堡实验室的工作人员在今后的病毒制备中不必再为此支付专利费用。

2014年10月,奥巴马政府认为Baric实验室使用SARS、MERS和流感等病毒进行功能获得性(Gainof function)改造的研究,对公共健康构成的潜在威胁,通过白宫科技政策办公室联合美国卫生与公众服务部发布禁令,宣布中止对类似研究的资金资助,并要求相关领域的研究人员立即停止相关的研究,直到研究项目的风险和收益被美国国家生物安全科学顾问委员会(NSABB)和美国国家学院国家科学研究委员会(NRC)的专家进行评估后方可继续。此后再发表论文时,Baric教授团队明显更加谨慎了,但该团队仅仅不再接受这项支助,研究项目及病毒嵌合的工作却没有因为奥巴马政府的命令而停止。

综上,嵌合病毒的方法发明自Baric教授,其团队拥有人类科学家中最权威的解释权和最强的嵌合病毒能力,因部分专利属于世界专利,如果各国科学家在病毒研究过程中产生了此项需求,需要向该团队进行申请并缴纳专利授权使用费。但无论从科学研究安全性还是从科研伦理学角度来看,研发嵌合病毒以及在此基础上进行病毒感染研究都是应该反对和抵制的。同时,嵌合病毒是一个较为复杂的过程,该过程中所使用的专业技术、专业软件均为该团队特有。此外,对嵌合技术有帮助的辅助软件、基因比对设备、大数据平台也均为美国特有,任何人使用都需要授权并留有使用痕迹。因此,世界上如果有未经美国授权的嵌合技术病毒产物,其嵌合过程一定发生在美国,这包括Baric教授的实验室或者与其有相同专利使用权限并有其毕业学生工作的德特里克堡(Fort Detrick)实验室。

第4章 关系分析

生物与化学科技是美国当代快速发展的基础之一,第二次世界大战以后,美国国内政治经济环境稳定,这为美国吸纳了大量的技术人才。在充分吸收并融合欧洲国家生物科技成果、前苏联生物科技成果、日本(原)731部队实验结果的基础上,美国的生物科学研究得到了长足的发展。

本章小结,本章节中展示的多方面关系人物之关联信息在关系图表中展示以后,可以清晰的发现,美国第45任总统特朗普(Donald John Trump)在新冠病毒(COVID-19)爆发时,对美国的微生物研究、病毒研究、药品研究有着充分的控制能力,同时也有多方面的顺畅渠道可用于了解病毒的危害。本文在新冠病毒的全球爆发原因的问题上保持客观、科学、严谨的立场,不会预设结论,但当此关系图表建立以后,无疑会令包括本文作者在内的所有社会公众对特朗普任职期间号召全民不戴口罩、保持密集聚会的行为及其初衷产生质疑。

第5章 安全风险

5.5 本章小结

科学的态度是科学发展的基础,科学态度既包括细致严谨的科学假设和科学求证过程,也包括科学的工作生活态度,对于一项科学研究应该尽可能的考虑全面,一味贪图急功近利的做法可能会给研究工作带来灾难性的后果。在生物学和微生物领域的研究尤为如此,稍有不慎就将给人类社会带来灾难性影响。从当前的国际疫情发展形势观察,新冠病毒很可能将伴随人类相当漫长的一段时期,谨希望Baric团队及在德特里克堡工作的相关团队,能够恪守科学研究的底线,严格防范安全风险,不要再产生新的不可控泄露事件。

第6章 结论与思考

本文以科学严谨的态度,不预设立场的进行了新冠病毒的溯源分析工作。作者首先从病毒的自然变异及自然产生原因开始,设定RNA病毒模型,并在此模型基础上进行了概率的计算,从而得出了新冠病毒自然起源概率接近于0%,人工嵌合病毒概率大于99.9%的结论。

在此结论的基础上,本文作者进一步的对美国分子生物学前沿领域和微生物学中病毒学的前沿领域进行了学习,以Ralph S. Baric教授的科研成果为入手点,下载并阅读了该教授从1983年至今近40年的400余篇论文研究成果,得出了美国存在病毒嵌合能力,其余国家不存在病毒嵌合能力的结论。

进一步的,本文通过对Baric教授论文的分析及对可靠新闻线索的搜集,完成了各方背景及社会关系的调查工作,并在这一工作中发现了第45任美国总统特朗普(Donald John Trump)的多方关系图谱,在这一图谱的指引下,本文作者对特朗普总统消极防疫、组织聚集、阻挠检测、号召不戴口罩的行为初衷和目的进行了合理怀疑。

再进一步的,本文通过对多方材料的整理和观察,发现了Baric教授团队存在的部分违规行为,并对这些违规行为可能带来的风险进行了预判和评估。为了说明这些风险存在的实际可能性,本文还将现实事件导入到风险事件当中,进一步的旁证了本文结论的正确性。

科学是一把双刃剑,当我们作为科学家挥舞起这把剑时,我们的心中一定要清楚,我们即可能给人类带来幸福,也可能给人类带来灾难。Baric教授是我崇拜的科学家之一,他把毕生的精力倾注于病毒科学的研究当中,其初衷很可能是为人类未来可能遭遇到的疾病提供解决方案,但因为求功心切或者被军方随意窃用了劳动成果,最终将灾难引至世界各地。这是何其悲哀的一件事情,一世英名毁于一旦,希望各行业的科学家都能引以为戒,认真严格的执行科学实验规范,恪守道德底线,以一颗无比敬畏的心对待工作当中的每一个细节。

附录

附录A,美国Baric教授所发表的,受到德特里克堡生物武器实验室支助、受到美国军方其它部门支助的论文和研究项目,参见:https://yunpan.360.cn/surl_yStpFeWgh7i (提取码:38ce)

附录B,参考文献目录,参见:https://yunpan.360.cn/surl_yStpbyIfdTh (提取码:6445)

参考文献

参见:https://yunpan.360.cn/surl_yStRsCGQvbL (提取码:f5e9)

致谢

感谢我的祖国,让我们生活在一篇净土!

感谢为防疫工作奉献了一切的每一位同胞!

相信坚持正确的领导,我们国家的明天一定会更美好!

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