如何看待新冠病毒疫苗(上)
一,冠状病毒的特征
已知冠状病毒为RNA病毒,它的RNA基因组编码4种或5种结构蛋白,分别为
棘突(spike, S)蛋白、
膜(membrane, M)蛋白、
核衣壳(nucleocapsid, N)蛋白、
血凝素酯酶(hemagglutinin-esterase, HE)蛋白(只有HCoV-OC43和HCoV-HKU1有表达)
包膜(envelope, E)蛋白
最早发现的冠状病毒是HCoV-229E、HCoV-OC43;2003年发现了SARS-CoV;此后又很快发现了HCoV-NL63、HCoV-HKU1;2012年发现了MERS-CoV。
这次爆发流行的是 SARS-CoV-2 (也曾命名为2019-nCoV);
在抗击2003年SARS-CoV、MERS-CoV时,医学界就开始了针对性的疫苗开发[1~3]。当时的研究就支持选择冠状病毒的棘突蛋白(Spike或简称S蛋白)作为靶抗原。
我们人为制造出冠状病毒的S蛋白,并采用各种技术思路送入人体送入人体当中,用它训练和激活人体的免疫系统,从而对抗未来可能入侵的新冠病毒。
为什么选择S蛋白?
因为S蛋白与宿主细胞上的血管紧张素转换酶2(ACE2)受体结合并诱导膜融合[4]。
与SARS-CoV-1、MERS-CoV疫苗研究的数据类似,我们同样观察到针对SARS-CoV-2棘突蛋白的受体结合域(RBD)的抗体可以阻止病毒附着到宿主细胞,且能中和病毒的观察结果。很自然,棘突蛋白、以及RBD成为COVID-19疫苗开发的主要抗原靶点[5]。
冠状病毒的示意图
二,新冠疫苗的技术路线
目前主要的已上市的新冠疫苗的主要技术路线如下:
1,灭活疫苗:
科兴生物(Sinovac)
国药集团(Sinopharm)中国生物、
武汉生物制品研究所
2,重组蛋白疫苗
美国诺瓦瓦克斯公司(Novavax);它主要采用NVX-CoV2373。、
俄罗斯的国家病毒学和生物技术研究所(Vector)
中国三叶草疫苗(SCB-2019)
3,腺病毒载体疫苗
中国康希诺公司(CanSino)、
美国强生公司(Johnson & Johnson)、
英国阿斯利康公司(AstraZeneca)、
俄罗斯加马利亚研究所(Gamaleya)
阿斯利康公司跟牛津大学合作,选择的是ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222(复制不全的黑猩猩腺病毒载体)。
强生公司采用腺病毒26作为载体。
中国康希诺公司采用腺病毒5作为载体。
俄罗斯加马利亚研究所的疫苗Gam-COVID Vac/Sputnik V。它是以腺病毒26载体初始剂量肌肉注射,21天后以腺病毒5载体增强剂量肌肉注射。
4,核酸疫苗,或者叫RNA疫苗
美国莫得纳(Moderna)公司、
德国BioNTech公司
德国的BioNTech公司的开发过程中,美国辉瑞(Pfizer)和中国的复星公司也有深度参与,所以也经常被人们叫做辉瑞疫苗。
辉瑞公司采用的是BNT162b2。
Moderna公司采用的是mRNA-1273。该疫苗还使用该公司的专利Matrix-M佐剂。
(这部分主要参考了王立铭、庄时利和两位老师的文章。)
三,不同的疫苗技术路线
1,灭活疫苗
灭活疫苗是一个经典的疫苗开发方法。其方法就是在实验室和工厂里大规模培养病毒,然后使用物理方法或化学物质破坏病毒的活性,再添加一些能够增强免疫反应的化学物质(学名叫做佐剂),最终制成成品疫苗。
注射灭活疫苗后,在理论上我们不能确定产生抗体针对的靶抗原是什么。不过实际临床工作里,发现注射灭活疫苗后,人体产生的抗体的靶抗原跟其他疫苗差别不大。
2,非灭活疫苗的技术路线
①,重组蛋白疫苗
就是人为把S蛋白的构象做改造,然后在工厂里生产出改造过的S蛋白,然后联合佐剂注射体内,从而诱导人体发生抗体。
Novavax疫苗的S蛋白有两个改造的地方,一个是使用了S-2P技术,插入了两个脯氨酸(K986P和V987P),另外一个在Furin酶切位点有三个突变(R682Q、R683Q和R685Q)。
这个小小的改变可以很好地稳定S蛋白构象,使得绝大部分的S蛋白都处于Prefusion的三聚体构象状态。
S-2P技术也运用在多种新冠疫苗上,包括两种mRNA疫苗(辉瑞、Moderna)以及腺病毒载体疫苗(强生)上。
②,腺病毒载体
把腺病毒加以改造,把负责生产新冠病毒S蛋白的基因放进去,然后直接把活的腺病毒注射到人体。
这些病毒进入人体之后可以感染一部分人体细胞,指挥这些人体细胞生产S蛋白。这样干脆把在工厂里生产S蛋白的步骤也给省略了,直接把人体变成疫苗生产车间。
③,核酸疫苗,或者叫RNA疫苗
这条技术路线就是制造出大量的、编码刺突蛋白的RNA分子,用脂纳米颗粒包裹起来,直接注射到人体中。
这些脂纳米颗粒可以和人体细胞融合,把RNA分子释放进入人体细胞。从而指挥人体细胞生产S蛋白。也同样省略了工厂生产S蛋白。
这条技术路线相对而言是最新的,在新冠疫情之前,人类还没有将任何一款核酸疫苗推进到3期临床。
可以通过社交媒体学习到很多知识。本篇很多内容经我查证后而摘自新浪微博。
四,关于疫苗的保护效果
随机对照研究时,保护率数据是这样计算的:
没打疫苗的感染率=A
打疫苗后的感染率=B
保护率数据=(A-B)÷A
很显然,保护率数据不只是由打疫苗后的感染率(即数据B)决定的。也很大程度受没打疫苗的感染率(即数据A)的影响。(感谢微博好友xiongyongqiang纠正了我的错误观点,从而才有了本篇正确的疫苗保护率计算方式。)
然而,当疫苗接种率高涨,整个人群的感染率下降时-----这恰恰证明疫苗有很好的保护效果。你可以发现计算出来的疫苗的保护率数据反而可能是下降的。
我们同样也可以发现,不同疫苗的保护率数据不好做对比------除非在同一个随机对照试验里。
因为不同纬度地区,不同社区人群(有不同的社交活动习惯),他们的基础感染人数(即数据A)是大大不同的。
而且,不同随机对照试验里的数据B的定义也可能有差异;因此,不同随机对照试验里的疫苗保护率不宜做直接对比。
目前各个已上市疫苗的保护率数据都可以查询到。可以发现国产疫苗的保护率数据不如BNT等国外疫苗。但因为不是同一个随机对照试验出来的,所以这些保护率数据是不能做对比的。
实际上,我只看到了英国的一个研究是直接对比BNT跟阿斯利康疫苗。该对照试验结论是:BNT疫苗好过阿斯利康疫苗。
因此,我后面提到的系列研究要注意几点:
不在一个随机对照研究里做对比,不同疫苗的保护率数据不可做直接对比。
真实世界的保护率数据受多因素影响;比如接种人数上升后,导致感染率下降的影响。
1,乌拉圭的真实世界数据
在今年5月时,南美洲国家乌拉圭卫生部的跨学科团队撰写的《疫苗有效性报告》日前公布。该报告的结果是根据截至5月25日86.27万人完全接种疫苗后的数据得出的,其中71.27万是科兴疫苗,15万是辉瑞疫苗。
在完成两剂科兴疫苗接种的71.27万人中,仅有5360人在接种第2剂疫苗14天后新冠检测呈阳性,其中19人需要进入重症监护病房治疗,6人死亡。
乌拉圭的数据显示,科兴疫苗能降低感染率57%,辉瑞疫苗能降低感染率75%;科兴疫苗使重症监护率降低95%,辉瑞使重症监护率降低99%;辉瑞预防新冠病患者死亡的有效率则是80%,比科兴的97%低。
该研究是真实世界研究。因为并非同时开展的随机对照试验,因此还不能依此断定两个疫苗的优与劣。
2,泰国的医护人员数据
今年7月,泰国宣布68万名医护人员完成接种两剂中国科兴灭活疫苗,4月至今共有618名医护人员确诊感染新冠病毒,其中1名护士病亡,另1名医护情况危重。
请注意,因为是医护人员。所以,他们的自我防护意识比较强,所以这个突破感染率是不能推广到所有人群的。
6月28日~7月2日,泰国对2239个新冠确诊病例样本进行检测,感染德尔塔毒株(印度 变异)的占比约32.2%~52.2%。
那么没有接种的数据呢?泰国医护人员科兴接种比例是97%。而没有接种的感染人数是2万,而感染人数100多,死亡6人。估算结果是真实世界保护率为80%。
3,来自美国的真实世界数据
美联社分析了 5 月份的数据,发现 853,000 多例新冠住院病人中,99.9%没完成疫苗接种;在超过 18,000 例新冠死亡病例中,99.2%没完成疫苗接种。美国CDC主任说,这些成年人的死亡本可避免的。美国现在新冠已经变成未接种者的流行病。
实际上,美国6~7月的新冠感染人数再次反弹。但主要发生在那些接种率低于40%的地区,而且也主要是那些未接种疫苗的人罹患。
4,来自土耳其的随机对照研究数据
今年7月,土耳其Hacettepe大学在Lancet发表了重磅文章,报道了科兴灭活病毒疫苗ConoraVac在该国3期临床试验结果。在这项3期RCT临床试验中,被随机分组后,6646人接受疫苗,3470人接受安慰剂。研究按照ITT开展。在接种两剂后的43天随访中,疫苗接种组9人发生有症状感染,安慰剂组32人感染。由此计算的疫苗保护率为83.5%(95% CI 65.4–92.1;p<0·0001)。
5,来自智利的真实世界数据
今年7月7日,智利卫生部在《新英格兰医学杂志》上公布了科兴新冠疫苗在智利的真实世界保护率数据。
该研究于2021年2月2日至5月1日进行,共统计1020万人。在接种完2针的人群中,预防Covid-19的效力为65.9%,预防住院的效力为87.5%,预防ICU的效力为90.3%,预防Covid-19相关死亡的效力为86.3%。
6,哥伦比亚的真实世界数据
哥伦比亚《周刊》7月8日报道:该研究由哥伦比亚卫生当局发起,针对哥伦比亚应用数量最多的新冠疫苗——科兴灭活疫苗(Sinovac)和辉瑞mRNA疫苗(Pfizer),统计了各年龄段受种者在完全接种2款新冠疫苗后被突破感染而死亡的几率。结果如下:
20岁以下及20到49岁的年轻人群:辉瑞疫苗和科兴疫苗均为0;50到59岁:辉瑞疫苗为0.023%,科兴疫苗为0;60到69岁:辉瑞疫苗为0.033%,科兴疫苗为0.03%;70到79岁:辉瑞疫苗为0.0137%,科兴疫苗为0.0329%;80岁及以上:辉瑞疫苗为0.088%,科兴疫苗为0.083%。
总的来说,接种疫苗是必要的。无论是国产疫苗,还是其他国际疫苗的有效率都较为理想。
相对可肯定的是,辉瑞/BNT疫苗为代表的mRNA疫苗的保护率似乎要稍好于其他疫苗。比如,英国一项严格的随机对照研究里,BNT疫苗的保护率要稍好于阿斯利康疫苗。但差距并不大。
但是,保护率点滴差距并没有那么重要。只要有足够多人接种疫苗,都足以让该病远离我们。唯一要担心的是接种人群不够多,以及接种的副反应。
(接种副反应等问题留待后续)
特别感谢来自新浪微博的朋友:
1,为格命思奔 。他本人在冠状病毒疫苗的研发方面做出过杰出贡献,比如对S蛋白的构象改造,从而让新冠疫苗成为可能。本文参考了他多篇新浪微博的文章。
2,庄时利和。他写过很多高质量的新冠疫情的文章。他对疫苗里的S蛋白改造的解读让我学到很多。从他那里学习到很多知识。
3,王立铭。王老师的文章《巡山报告 No.24:有了疫苗,世界会好么?》通俗易懂,可以作为理解新冠疫苗的门槛。本篇文章大量引用该篇文章内容。
4,子陵在听歌。他持续不断为我们解读各种新发表的学术研究论文,尤其是感染病学、疫苗等领域的内容。让我对新冠感染的最新进展不陌生。
5,LeBonHomme。我从他学到了很多关于新冠病毒,以及如何研读疫苗的保护率数据的研读等,
6,xiongyongqiang。我曾写微博涉及疫苗保护率计算方式。但我搞错了,是他纠正了我。我从他那里学习到很多知识。
7,鼎盛风清。从他的微博可以找到各种新冠疫苗研究的数据,是一个关于新冠疫苗研究的宝藏。最后一个关于哥伦比亚的研究报告完全摘自他的微博。
实际上,我还从其他不少朋友那里学习到很多。本篇文章大量参考了他人的文章、微博内容,但却未能一一致谢。
参考资料:
1,Graham RL, Donaldson EF, Baric RS. A decade after SARS: strategies for controlling emerging coronaviruses. Nat Rev Microbiol 2013; 11:836.
2,Tortorici MA, Veesler D. Structural insights into coronavirus entry. Adv Virus Res 2019; 105:93.
3,Pallesen J, Wang N, Corbett KS, et al. Immunogenicity and structures of a rationally designed prefusion MERS-CoV spike antigen. Proc Natl Acad Sci U S A 2017; 114:E7348.
4,Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020; 579:270.
5,Krammer F. SARS-CoV-2 vaccines in development. Nature 2020; 586:516.