印度人说新型冠状病毒是人为从HIV设计来的,NO!
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没想到还能吃个算是科研瓜?
起因是这个,一个印度人,说他发现新型冠状病毒和HIV有几个片段,很相似,而且这几个片段别的冠状病毒没有。
那有几个片段呢?
四个!
然后他就说,这种相似性,不太可能是偶然的。
哇!外网炸了啊!你这是人工合成的病毒啊!你这是从HIV转化来的啊!你这……其心可诛啊!
不过,很快就有人看不下去了,表示你写的这是啥玩意儿啊?他们在一个自我定位为类似于维基百科的叫做Prepared的论坛上发表了文章《不!2019-nCoV的基因序列并不是从HIV基因编辑来的》。(在第3页我附了全文)
作者先是阅读了印度人的文章(在第2页),先是总结了一下印度人干了啥。
我简单概括一下,就是他们从28个新型冠状病毒感染的患者体内提取了28个2019-nCoV的序列,并将这些序列和其他来自蝙蝠的冠状病毒相比较,虽然两者之间有96%都是相似的,但仍然有1200多个DNA碱基和蛋白质残基是不一样的。
然后印度人研究了其中4个片段,这几个片段虽然在链上看起来还挺远的,但是进行3D建模之后,就会发现他们都在2019-nCoV的“尖峰蛋白”中,“尖峰蛋白”可以让病毒识别ACE2受体,穿透粘膜细胞。
再然后他们一顿搜索数据库,发现这四个片段看起来都与HIV病毒至少一个变种中的至少一个序列相匹配,也就是HIV中的gp120和Gag蛋白,前者也是一种病毒包膜识别蛋白。
而这四个片段有多长呢?6个残基(as short as 6 residues.)。
所以这篇文章的作者接下来指出,序列重叠并不奇怪,然后发出了对科研工作者(如果印度小组算的话)的致命一击:你这也没啥大的独家新闻啊,你们是不是陷入研究的一些陷阱啊?
(and there is no big scoop here. The group in India fell prey to some of the pitfalls of bioinformatics research.)
为啥这么说呢?作者给了三个原因:
1、没有任何显著信息能证明2019-nCoV一定是从你用的那个蝙蝠的冠状病毒来的
2、与HIV匹配的序列非常短,出现在两种病毒的高变区,2019-nCoV序列与许多其他生物体之间也出现类似的重叠。
3、从理论上讲,HIV序列可以赋予另一种病毒的独特生物学特性在2019-nCoV中完全缺失,而且2019-nCoV没有已知的冠状病毒可能没有的独特临床特性。
2019-nCoV无论从基因序列上的变异来讲,还是临床表现来讲,和其他冠状病毒并没有什么大的差别。和HIV基因序列重叠的部分也不明显,6个残基,太短了,而且这个重叠没什么特别的效果,这里有个很关键的信息是,2019-nCoV识别的是ACE2受体并侵入粘膜上皮,而HIV的gp120蛋白识别的是CD4受体并侵入CD4+T细胞(一种重要的免疫细胞)。
很多人可能会联想到之前王广发说HIV药物或许可以用于这次肺炎的治疗,但这也不能证明新型冠状病毒和HIV之间有什么必然联系,毕竟他俩的共同之处,可能就只有都是RNA病毒吧……
印度人文章
辟谣文章