转:英国用敲除繁殖限速基因的噬菌体治疗耐药菌感染成功一例

英国伦敦有个小女孩叫伊莎贝尔·卡内尔,患有一种叫囊性纤维化的遗传病,其自体分泌的粘液会堵塞肺部,让细菌有机会侵入;她从7岁开始就使用多种抗生素,到15岁时,她体内的细菌基本就对一切抗生素都有耐药性了(哇,如果是纳粹德国恐怕会把这个孩子杀掉再焚烧其接触过的一切物品了,因为等于是一个耐药菌母巢,她身上的超级细菌传染出去英国可能要闹生化危机了?不过也许大多是非空气传播的品种没有那么危险?)……

后来甚至做了双肺切除和移植手术。不过依然没法治好,而且她身上的细菌不断繁殖连胳膊和悲伤地皮肤都能看到斑痕了。

其主治医生求助于医院的病毒专家,然后后者在90年代于格鲁吉亚首都第比利斯认识了个研究分枝杆菌噬菌体(可以杀死细菌的病毒)的遗传学专家格拉哈姆·哈特富尔。

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文中提到苏联由于处在技术封锁状态,无法接触到当时最先进的抗生素,所以投巨资研究噬菌体。但是由于噬菌体往往是一种噬菌体只能对付一种细菌,不具有广谱性杀菌效果,所以每次用药都必须先精确化验细菌品种,再找出来对应的噬菌体(可能还要冷链?)配送过去,成本反而更高,所以在国际上还是被边缘化了。

文中后来说这个格拉哈姆任职于匹兹堡大学,不知道是不是苏联解体后美国从格鲁吉亚挖走的人才?还是这人在冷战期间去苏联进修过?

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言归正传,格拉哈姆获得了女孩身上的分歧杆菌样本后,用上万种噬菌体进行筛查,发现从南非德班的一根烂茄子上找到的被命名为Muddy的噬菌体可以杀死分歧杆菌。

但是细菌和噬菌体也是存在互相竞争进化的过程的,他担心只用一种噬菌体可能会产生耐药性问题(我觉得是产生耐穿刺问题吧?从图片上看噬菌体就像一个注射器,抓住细菌就把自己的针头插进去,注入自己的DNA复制,如果细菌进化出耐穿刺外壳,或者进化出光滑外壳令其抓不住就不会被刺穿了)……

就又找了两种结构和Muddy类似,有穿刺耐药性分歧杆菌的能力,但繁殖速度太慢,不足以杀死分歧杆菌宿主的(共生型?)温和噬菌体,通过基因编辑,将其限制繁殖速度的基因给敲除了,使其能大量繁殖吸光、撑炸分歧杆菌,并命名为BPs和ZoeJ。

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(原文与图片来源:https://huanqiukexue.com/a/qianyan/shengwu__yixue/2019/0514/28278.html,左边的是Muddy,中间和右边的是BPs和ZoeJ)

接下来他和他的团队手工敲除做好了一堆BPs和Zoej,加上Muddy,快递给英国伦敦的那家儿童医院,给那孩子注射,就把她的病情控制住了。

不过孩子身上依然有一些斑块残留,从中还是可以检测出耐药菌。

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原文里说这孩子的身体状况已经大为好转,还学会了开车能出去兜风……但我感觉英国那些医生心真大,一点都不担心这种在繁殖速度限制基因敲除噬菌体和天然噬菌体双重攻击下,都能存活的超级细菌的携带者,把其身上的细菌传播出去啊……

虽然不能像纳粹那样动不动就消灭所谓的劣等基因携带者,但是应该让其住到偏远地区去隔离起来,慢慢观察吧?

不过考虑到,好几年前就有新闻说,就在夏威夷群岛上,发现有青霉素耐药性5000倍的超级淋病梅毒螺旋体了,也可能欧美医生们已经见惯了各种超级细菌、真菌、衣原体、支原体、螺旋体了,早已经见怪不怪,不在乎了?

或者这种超级(类似肺结核的)耐药分歧杆菌对于没有囊性纤维化遗传病的正常人来说,是致死率比较弱的?所以不怕它扩散出去?

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据说一些噬菌体公司由此受到了鼓舞,打算开一些针对耐药菌定制噬菌体的特种治疗诊所了——哇,英国莫非耐药菌遍地了?不愧是从1959年开始就率先批准给鸡打青霉素的国家……

此次治疗成功的例子,其实给医药行业最大的启示,可能就是,噬菌体是可以通过人工基因编辑技术增加其杀伤力的,那么,别的科学家认为也能增加其杀伤范围,理论上可以创造出广谱噬菌体。

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个人猜测,噬菌体的繁殖速度通过基因编辑被人为调大后有两个好处,一个是之后它就算一种人工产物了,和转基因农作物一样可以申请专利了,这样可以刺激风险投资者对其进行投资,加快行业发展速度(当然也有可能产生新的垄断企业);

另一个是,它的繁殖速度特别快的话,一旦将病人身上大部分的细菌都杀死,然后没有可以寄生的对象了,它就会被饿死,这样应该就不容易扩散出去了?(当然逆向思考的话,大量繁殖后,又找不到合适寄生对象的噬菌体在人体内广泛存在,是否会变异然后攻击益生菌或其他中性菌也不好说……)

本次事件有点像是人类对细菌发动了基因编辑后的强化病毒战……但至少目前投放的2种基因编辑病毒对人是无害的……

理论上,类似养殖益虫对付害虫,如养赤眼蜂对付棉铃虫也算有机农业,生态治虫的做法,应该是提倡的;但是如果对赤眼蜂进行基因编辑,敲除其繁殖速度限制基因,令其超速繁殖加大杀伤力,也说不清楚是不是值得提倡了……

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最好以后的人类城市都分散化,城镇化,避免出现超级大城市,然后尽可能搞无纸化远程办公模式,物资流转过程中可以用冷链,或者真空封装,或者紫外线物理消毒模式,这样可能能尽量防止超级耐药菌或病毒的传播速度加快吧……

物理隔离也是一种避免问题加速扩散的方法。

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话说前几年还有个新闻,有美国科学家用伊波拉病毒去感染基因编辑过的烟草,令其产生类似抗体的物质,然后将抗体提取出来,给俩不幸传染上病毒的医生进行治疗,使其活了下来……

也就是用基因编辑过的植物生产类似抗体血清的东西,而不是用马等动物去生产,让烟草从致癌物变成救命药,那个思路蛮新奇的……万一以后噬菌体失控的话,或许可以用那种基因编辑烟草来救命~~

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