全球首例!知名华裔学者发明“查找-替换”式基因修复技术,成功治愈罕见病

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2025年12月7日,《新英格兰医学杂志》刊发了一项里程碑研究:一名患有免疫缺陷疾病的19岁加拿大青年,成为全球首位通过“引导编辑”技术获得治愈的患者。这项新技术如同“生命文本”基因的“查找—替换”工具,无需剪断DNA双链,便能精准定位并修正致病基因,避开了传统基因编辑的主要风险。然而,当医学能够精准改写生命密码,技术的边界、伦理的底线与现实的困境,也随之站到了时代面前。

撰文 | 李娟

基因就像生命的说明书,记载着身体所有细胞如何运作的指令。如果这本说明书里,某个关键的词语出现了拼写错误,会发生什么?

对于19岁的加拿大不列颠哥伦比亚省的青年Ty Sperle来说,这个拼写错误导致他患上了一种罕见的遗传病——慢性肉芽肿病(Chronic Granulomatous Disease, CGD)。

自五岁被诊断以来,Ty的生活就与无休止的感染和药物相伴。他的免疫系统,本应是抵御细菌和真菌的卫士,却因为基因中的一个微小错误而变得脆弱不堪。最普通的感冒、小小的伤口,都可能演变成危及生命的重症。

传统的治疗方法,比如长期服用抗生素和抗真菌药,无法彻底纠正基因错误。骨髓移植虽然能根治,但风险巨大,且需要找到合适的捐献者。在漫长的煎熬中,Ty和他的家人都在渴望一个真正“治愈”的机会。

2025年,这个机会来了。这年夏天,Ty在蒙特利尔的一家临床试验中心接受了一项开创性的治疗,成为了全球首位通过“引导编辑(Prime Editing)”技术被治愈的患者。

2025年12月7日,该临床试验结果在《新英格兰医学杂志》发表,结果令医学界振奋:在治疗一个月内,Ty的免疫细胞中的基因“拼写错误”就被修复完好,“杀敌”功能得以正常发挥,并在随访期间持续维持,他无需再长期服用抗生素等药物了[1, 2]。

“这是奇迹般的治愈。Ty现在可以像普通人一样生活了——上大学、露营、旅行……做所有同龄人能做的事。”Ty的医生Stuart Turvey博士在受访时兴奋地表示。

要理解这个“奇迹”为何如此重要,我们需要回到76年前,回到这个疾病被首次发现、并被宣判为“致命”的时刻。

藏在细胞里的致命缺陷

1950年,明尼苏达大学医院接诊了一名12个月大的男孩,他反复感染、淋巴结化脓、肝脾肿大、肺部浸润,还伴有湿疹样皮炎。医生们从未见过这样的病例。接下来的几年,又有三名男孩出现了几乎相同的症状。儿科医生和免疫学家发现:患儿白细胞数量正常,但免疫系统似乎存在严重功能性缺陷。这是一种全新的疾病[3,4]。

1957年,他们在期刊发表论文,将这种疾病命名为“儿童致命性肉芽肿病”(A Fatal Granulomatosus Disease of Childhood)。1959年,第二篇论文发表时,4名患儿中已有3人死亡。在1960年代,患这种病的孩子7岁前死亡率超过60%,预期寿命不到10岁。

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1959年的论文截图。| 图源:参考文献[4]

为什么这些孩子会反复感染?答案在1967年得以揭晓。

哈佛医学院的研究者发现,CGD患儿的白细胞在吞噬细菌时,无法产生活性氧[5]。正常人的免疫细胞(尤其是吞噬细胞,如中性粒细胞、巨噬细胞)吞噬细菌后会启动“呼吸爆发”(respiratory burst)机制,产生大量超氧化物等活性氧,像化学武器一样摧毁病原体。但CGD患者的细胞虽然能吞噬细菌,却无法将其杀死,就像士兵包围了敌人,却没有武器消灭他们。

随后的研究发现,问题出在细胞中的一种酶——NADPH氧化酶复合体。它由多个蛋白质亚基组成,任何一个亚基出现缺陷,整个酶系统就会瘫痪[6]。那么,具体是哪个亚基的基因出了问题?这个基因在染色体的什么位置?

直到1986年,波士顿儿童医院的科学家在《自然》发表开创性论文:他们首次克隆了CGD的致病基因之一:位于X染色体的CYBB(Cytochrome b-245 beta chain),并证明了CGD中最常见的类型是X连锁遗传[7]。后续研究证实CYBB基因编码的gp91phox是NADPH氧化酶复合体中的关键催化亚基[8, 9]。

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CGD的常见病因是X染色体上的基因变异。 | 图源:参考文献[6]

这项工作的革命性在于,研究者在不知道蛋白质序列的情况下,仅根据染色体位置就找到了疾病基因。他们利用CGD经常与杜氏肌营养不良症(DMD)伴发的临床观察(两个基因都在X染色体相邻区域),通过“染色体步行”技术,像侦探追踪线索一样,一步步接近目标基因,最终成功捕获。

这是人类医学史上首次通过“位置克隆”方法鉴定疾病基因,也是首个被定位并克隆的原发性免疫缺陷病基因之一,这个方法为之后数千种遗传病基因的发现开辟了道路。

随后几年,其他CGD相关基因陆续被鉴定,其中,像患者Ty带有的NCF1基因(编码p47phox)突变约占20%–25%的病例,是最常见的常染色体隐性类型。与此同时,大约65%–70%病例源自X染色体上的CYBB基因突变[10, 11]。

不过,致病基因的发现并没有立即带来治愈。随着抗生素、干扰素-γ、造血干细胞移植等措施的改进,CGD患者的生存率开始提高。到21世纪初,至少50%的CGD患者能够存活25年以上。

在CGD基因图谱建立约30年之后,这种罕见遗传疾病的真正治愈在Ty身上实现了。这30年间,一项载入史册的生物技术诞生并迅速迭代——基因编辑。

精准修正生命的底层密码

2012年,CRISPR-Cas9技术横空出世,被誉为“基因剪刀”。它能在DNA的特定位置进行精确剪切,因其高效简便而迅速风靡全球,两位发明者因此获得2020年诺贝尔化学奖。

这项技术在临床上的首次重大成功案例之一,是美国患者Victoria Gray的故事。

Victoria患有严重的镰状细胞贫血症(Sickle Cell Disease, SCD)。2019年,她成为全球首位接受CRISPR基因疗法治疗的SCD患者。医生从她体内取出造血干细胞,在体外利用CRISPR-Cas9技术对这些细胞进行基因编辑,使其能够产生一种胎儿血红蛋白,从而间接缓解症状。治疗后,Victoria的病情得到了显著改善,疼痛危机大大减少,生活质量得到了质的飞跃[12, 13]。

2023年12月,基于CRISPR的首款基因疗法Casgevy获FDA批准上市,用于治疗SCD和输血依赖型β地中海贫血,标志着基因编辑从实验室走向临床,成为真正可以治愈疾病的药物[14]。

然而,CRISPR-Cas9并非完美无缺。它的主要局限在于,为了编辑基因,它必须剪断DNA双链。虽然细胞有修复断裂的机制,但这个过程容易出错,更关键的是,CRISPR不擅长修复小片段突变。

对于Ty这样仅仅缺失两个核苷酸(GT)的患者,CRISPR显得力不从心。这正是Prime Editing诞生的背景。

2019年,哈佛大学和麻省理工学院Broad研究所的刘如谦(David R. Liu)教授团队在《自然》杂志报道了引导编辑技术[15],并于2025年获得 “科学突破奖(Breakthrough Prize)”。

相比传统CRISPR-Cas9系统,引导编辑最大的创新就是避免了DNA双链断裂,具有更高精准度、更广适用范围、更高安全性的优势。该系统能够像文档的“查找-替换”功能,精确找到错误后直接改写。

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两种基因编辑策略的对比。左图为CRISPR-Cas9编辑,由gRNA引导Cas9产生DNA双链断裂,可通过同源定向修复利用模板校正基因,也可能通过末端连接产生非预期插入缺失;右图为引导编辑技术,改造后的Cas9(仅切单链)与逆转录酶融合,结合含校正序列的pegRNA,通过逆转录合成校正DNA,经细胞修复系统完成精准基因编辑,无需双链断裂。在引导编辑系统中,Cas9相比传统CRISPR-Cas9编辑进行了三处改造:1)其双链切割能力被改变,仅能切割单链DNA,从而产生单链切口;2)其所携带的RNA包含突变区域的校正序列,因此被称为引导编辑向导RNA(pegRNA);3)Cas9蛋白与逆转录酶融合为一体:形成的融合蛋白既能通过Cas9结构域切割DNA产生切口,又能通过逆转录酶结构域将RNA转录为DNA。| 图源:参考文献[19]

以上优势让引导编辑成为“游戏规则改变者”。研究者认为,理论上来说,该技术让大多数致病遗传变异都有了被精准修复的可能。

2024年,Ty Sperle入组了PM359临床试验[16]。PM359是一种自体造血干细胞疗法,专门针对p47phox缺陷型CGD,利用引导编辑技术纠正NCF1基因第2外显子上的两个核苷酸缺失(delGT)。

治疗过程可大致分三步:

第一步提取“种子细胞”:从Ty骨髓中提取造血干细胞,它们是包括免疫细胞在内的所有血细胞的“种子”,具有自我更新和多向分化能力。

第二步实验室“修错字”:在体外,PM359精确定位缺失基因位点,用Prime Editing技术将其恢复为正常序列。

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上图:在Ty Sperle案例中,常染色体隐性遗传的 p47phox缺陷型 CGD (p47-CGD) 主要由NCF1基因第2外显子上的两个核苷酸缺失 (delGT) 引起。下图:引导编辑系统修复该基因缺陷的过程。 | 图源:参考文献[1]

第三步清除与回输:在回输之前,Ty接受骨髓清除预处理,清除体内部分缺陷细胞。随后,经过基因修正的自体造血干细胞被输注回体内,在骨髓中定植、增殖、分化,逐渐产生功能正常的免疫细胞。

临床数据显示,治疗后Ty的中性粒细胞中的NADPH氧化酶活性持续维持,未观察到显著的脱靶效应,表明该治疗技术有效且安全。

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基因修复之后,NADPH氧化酶复合物的全部亚基正常组装,活性氧得以产生并释放。 | 图源:参考文献[1]

从1950年那个明尼苏达州的12个月大男孩,到2026年被治愈的Ty Sperle,数十年的时间跨度见证了人类从对该疾病一无所知,到发现病因、克隆基因、开发诊断工具,再到最终实现精准基因修正的完整历程。

希望、边界与未来之路

Ty Sperle的治愈只是基因治疗探索大潮中的一朵浪花。让我们把视野拉开,看看这个领域正在发生什么。

在引导编辑技术之前,刘如谦团队还开发了碱基编辑(Base Editing)技术。如果说CRISPR是“剪刀”,引导编辑是“字处理器”,那么碱基编辑就像“橡皮擦+铅笔”——它可以在不剪断DNA双链的情况下,将一个碱基精确转换为另一个(如A→G,C→T),进行“单字母”的错误修复。然而,碱基编辑只能完成有限的碱基转换,许多遗传突变,例如插入、缺失或复杂突变,都无法通过这种方式修复。但也有其适宜的应用场景。

目前,这项碱基编辑技术正被用于试验治疗镰状细胞贫血症。2025年12月的临床数据显示,患者的胎儿血红蛋白水平显著提高,疼痛危机大幅减少。这是碱基编辑技术在临床应用中的重要进展[17]。

在癌症治疗领域,使用基因编辑工具改造患者的T细胞,使其能够准确识别并强力杀灭癌细胞。目前最火热的当数CAR-T疗法,其已在某些血液癌症中取得突破性进展。多款CAR-T产品已获FDA批准上市。

在罕见病领域,全球有超过100项基因编辑临床试验正在进行,涉及的疾病领域包括血液疾病、眼科疾病、肝脏疾病、代谢性疾病,以及复杂神经退行性疾病。

尽管Ty Sperle和Victoria Gray的案例令人振奋,但这些都是相对较新的治疗。基因编辑疗法的长期疗效和安全性仍需时间来验证。另外,基因治疗作为一种高度复杂和个性化的先进疗法,其研发、生产和实施成本极为高昂。目前已上市的基因疗法,单剂价格往往高达数百万美元,例如Casgevy的定价就高达220万美元[20],对医保体系和医疗可及性都是挑战。

更重要的是,基因编辑技术的伦理和社会争议也备受关注。这把“双刃剑”在带来巨大希望的同时,也带来了潜在的风险和道德困境。

比如,目前临床应用主要针对体细胞编辑,其基因改变不会遗传给后代。但如果编辑生殖细胞(精子、卵子或早期胚胎),其基因改变将遗传给后代,会引发“设计婴儿”的伦理担忧。基因编辑技术是否会被用于非治疗目的,例如增强人类的智力或体能等特征,从而模糊疾病与“正常”的界限?

真正的考验或许才刚刚开始。

参考文献

[1] Gori JL, Haddad E, Frangoul H, et al. Prime Editing for p47phox-Deficient Chronic Granulomatous Disease. N Engl J Med. Published online December 7, 2025. doi:10.1056/NEJMoa2509807

[2] ‘Like a spelling mistake’: B.C. teen’s DNA ‘corrected’ to cure rare disease. Global News. February 27, 2026.

[3] Berendes H, Bridges RA, Good RA. A fatal granulomatosus of childhood: the clinical study of a new syndrome. Minn Med. 1957;40:309-312.

[4] Bridges RA, Berendes H, Good RA. A fatal granulomatous disease of childhood; the clinical, pathological, and laboratory features of a new syndrome. AMA J Dis Child. 1959;97:387-408.

[5] Baehner RL, Nathan DG. Leukocyte oxidase: defective activity in chronic granulomatous disease. Science. 1967;155:835-836.

[6] National Institute of Allergy and Infectious Diseases | health information NIAID U.S. DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES Chronic Granulomatous Disease A Guide for Adolescents and Young Adults.

[7] Royer-Pokora B, Kunkel LM, Monaco AP, et al. Cloning the gene for an inherited human disorder—chronic granulomatous disease—on the basis of its chromosomal location. Nature. 1986;322:32-38.

[8] Dinauer MC, Orkin SH, Brown R, et al. The glycoprotein encoded by the X-linked chronic granulomatous disease locus is a component of the neutrophil cytochrome b complex. Nature. 1987;327:717-720.

[9] Teahan C, Rowe P, Parker P, et al. The X-linked chronic granulomatous disease gene codes for the β-chain of cytochrome b-245. Nature. 1987;327:720-721.

[10] Leiding JW, Holland SM. Chronic Granulomatous Disease. In: Adam MP, Feldman J, Mirzaa GM, et al., editors. GeneReviews®. Seattle (WA): University of Washington; 2012 [Updated 2022].

[11] Roos D, de Boer M. Molecular diagnosis of chronic granulomatous disease. Clin Exp Immunol. 2014;175:139-149.

[12] Frangoul H, Altshuler D, Cappellini MD, et al. CRISPR-Cas9 Gene Editing for Sickle Cell Disease and β-Thalassemia. N Engl J Med. 2021;384:252-260.

[13] Innovative Genomics Institute. CRISPR Clinical Trials: A 2024 Update. March 13, 2024. https://innovativegenomics.org/news/crispr-clinical-trials-2024/

[14] U.S. FDA. FDA Approves First Gene Therapies to Treat Patients with Sickle Cell Disease. December 8, 2023.

[15] Anzalone AV, Randolph PB, Davis JR, et al. Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA. Nature. 2019;576:149-157.

[16] ClinicalTrials.gov. A Study of the Safety and Efficacy of Prime Editing in Participants with Autosomal Recessive Chronic Granulomatous Disease. NCT06559176. https://clinicaltrials.gov/study/NCT06559176

[17] Beam Therapeutics. Beam Therapeutics Reports Updated Data from BEACON Phase 1/2 Study of BEAM-101 in Patients with Sickle Cell Disease. December 6, 2025.

[18] Doman, J.L., Sousa, A.A., Randolph, P.B. et al. Designing and executing prime editing experiments in mammalian cells. Nat Protoc 17, 2431–2468 (2022). https://doi.org/10.1038/s41596-022-00724-4

[19] Urnov FD. Prime Time for Genome Editing?. N Engl J Med. 2020;382(5):481-484. doi:10.1056/NEJMcibr1914271

[20] Reuters. Vertex/CRISPR price sickle cell disease gene therapy at $2.2 million.

December08, 2023. https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/vertexcrispr-price-sickle-cell-disease-gene-therapy-22-mln-2023-12-08/

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