最新变种依旧不能改变屁股,转载文章有感。

作者:nesmto链接:https://www.zhihu.com/question/501882515/answer/2245024673来源:知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。Omicron可能对依赖疫苗的“共存”国家产生重大影响,但对坚持“动态清零”的国内影响有限一.Omicron(B.1.1.529)是新生事物,特性尚不确定1.变异带来可能的新特性

病毒学家Prof. Tulio de Oliveira提到

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理论上:

毒株存在多个 RBD 和 NTD 突变,影响中和抗体(和治疗性单克隆抗体)的有效性靠近 S1/S2 弗林蛋白酶切割位点的突变簇 (H655Y+N679K+P681H),更有效的进入细胞,更强的传播能力。nsp6 删除 (A105-107)-类似于 Alpha、Beta、Gamma、Lambda的突变,可能与逃避先天免疫有关(干扰素拮抗)→ 也可以增强传染性。核衣壳中的 R203K+G204R 突变 - 见于 Alpha、Gamma、Lambda-与传染性增加有关。2.从B.1.1.529的表现看,突破免疫应该可以确认了500500灰色为原始毒株、绿色为beta,灰色是alpha,红色为delta,黄色为C.1.2,蓝色为新出的B.1.1.529

B.1.1.529在南非增长迅猛,已经引发新一轮波峰。[1]

500500灰色为原始毒株,绿色Beta,蓝色为Delta

可见夏季Delta导致的疫情波峰后,由于多数居民在接种疫苗或感染后,都产生了抗体,Delta疫情已经很难继续传播。

而B.1.1.529基本不受之前抗体的影响,才能异军突起。

来自拍老师[2]的评论:

新毒株跟Delta没有中和抗体交叉免疫力,可能是新“血清分型”。3.流行病学专家Eric Feigl-Ding博士说该变种传播力比Delta高了500%500500

[3]

500500500500横轴为时间,纵轴为百分百4.奥地利IMBA分子生物技术研究所专家Ulrich Elling谈Omicron奥地利IMBA分子生物技术研究所专家Ulrich Elling谈Omicron

病毒在关键的刺突蛋白区域有32个突变。

由于Omicron新病毒的爆发,南非豪登省的病例在25天内翻了几百倍。

相比Delta,病毒传播速度快了500%,还有免疫逃逸的特性。

病毒传播的速度很快,Rtt高得封城都难以控制。所以唯一的方式是停止航班,将病毒拦截在国境之外。

致病性还需要研究确认。[4]

5.由于发现时间尚短,它的传播动力学特性、突破免疫的能力、重症率、致死率还需要一段时间的观察才能明确二.全球流行基本不可避免1.南非的流行情况

剑桥大学COG-UK基因组学英国联盟主任,公共卫生和微生物学教授Sharon Peacock教授说:

"南非卫生部和支持科学家昨天发布了有关新型SARS-COV-2变体的重要证据。这被称为谱系 B.1.1.529,可以在此处找到该信息: https://www.youtube.com/watch?v=Vh4XMueP1zQ

"尽管与英国的每日病例数相比,南非的COVD-19病例数较低,但在过去7天中观察到病例数迅速增加。

记录的COVID-19感染人数2021年11月16日为273例。到11月25日,这一数字已上升到1200多例。其中80%以上来自豪登省。豪登省的病例最初似乎是聚集性的,但随着时间的推移,感染在全省范围内更广泛地扩散。

豪登省的疫情动态:

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全南非的情况:

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来源:南非46周疫情周报 (访问密码 : 1127)

"对整个南非的R值(增长率的衡量标准)的分析为1.47,但豪登省的初步估计为1.93。根据这一测量,它表明豪登省的病例增长率大大高于该国其他地区。

"南非卫生部和科学家迅速根据这一信息采取行动,对豪登省PCR检测呈阳性的人的阳性样本进行基因组测序。这确定了一个新的变异B.1.1.529,它具有非常不寻常的突变星座和与已知关注的变异不同的突变特征。1.1.259变异基因组有大约50个突变,但其中超过30个在刺突蛋白中,刺突蛋白是蛋白质在细胞进入之前与人类细胞相互作用的区域。受体结合基序(与我们的细胞受体结合的部分称为hACE2)有10个突变(比以前关注的变体更大)。

"现在在南非已经发现了大约100个B.1.1.529个基因组,主要来自豪登省。但这个地区也是测序的目标地区,问题是变异体是否存在于更广泛的地理区域。[5]

2.多个国家已经有病例或者有输出病例

由于南非豪登省的约翰内斯堡是南部非洲的交通中心、商业中心,所以疫情很容易扩散到周边国家。

博茨瓦纳、南非、以色列和中国香港都发现了该突变株。

当地时间11月26日,以色列卫生部发表声明称,该国发现其境内首例感染新型变异新冠病毒B.1.1.529的病例,来自马拉维。[6]

比利时26日报告首例新型变异新冠病毒感染病例,26日晚些时候,比利时流行病学专家马克·范兰斯特(Marc·Van·Ranst)在其推特账户称,该患者11月11日从埃及返回比利时,11月22日开始出现新冠病毒感染症状。[7]

从以上信息看,非洲是可能的源头。但由于非洲多个国家稀烂的卫生水平、流调能力和测序能力,已经无法判定突变株的准确来源了。

3.多个国家开始限制来自非洲的航班

世卫决定发出后,美国宣布了对非洲八国的旅行限制,这些国家包括南非、博茨瓦纳、津巴布韦、纳米比亚、莱索托、斯威士兰、莫桑比克和马拉维。此前,英国、法国、以色列等国家已经宣布将颁布旅行禁令。其中,英国已从26日开始暂停来自南非、纳米比亚、莱索托、斯威士兰、津巴布韦和博茨瓦纳六个非洲国家的航班。

以色列政府已决定,将除北非国家以外的所有非洲国家列为“疫情红色”国家,禁止上述国家人员入境以色列。同时任何从非洲国家入境以色列的人员均须接受7天至14天的强制隔离。

11月27日早晨,已经有27个国家限制来自非洲的航班。[8]

4.部分西方学者继续坚持共存想法

爱丁堡大学传染病流行病学教授Mark Woolhouse教授说:

"没有人应该对新的SARS-CoV-2变体的出现感到惊讶。delta变体最终将被替换,无论是被这个最新的新变体 - B.1.1.529 - 还是其他一些变体所取代。我们迟早会遇到一种变异,这种变异比δ更具传染性,或者更善于逃避自然和疫苗诱导的免疫力,或者两者兼而有之。

"全世界的基因组监测对于尽快检测变异至关重要,但这只是第一步 - 新的变异一直在出现,大多数都不是主要问题。需要临床、流行病学和实验室研究来确定是否应将新变异体指定为"关注变异体"。这需要时间,在此期间,变体将在本地和国际上传播。

"旅行限制可以延迟但不能阻止高度传播的变体的传播。如果B.1.1.529比达美航空更具传染性,那么它迟早会到达英国;今年早些时候,delta遍布世界各地。旅行限制的作用是为我们提供一些时间,它们的价值取决于我们对这段时间做了什么。当务之急必须是确定B.1.1.529是否真的对公众健康构成重大威胁。如果是这样,那么我们有一套工具可以减轻其影响。

"'与病毒共存'的概念意味着与新的变异共存,我们对任何新变异的反应都必须被衡量,相称和可持续。这是通过加强筛查和测试使旅行更安全的论据,而不是完全禁止旅行。[5]

5.疫情全球扩散难以避免

目前已经确认有突变株的非洲和中东国家有:

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分析:

1.突变株来源不明,不能假定疫情在南非先现,疫情其他非洲国家可能早已经有传播,只是因为没有测序所以不知道。Omicron也可能先出现在中非或者地区地区。

2.目前除了欧美27国限制非洲南部航班外,其他国家还没有及时停止与非洲南部地区的交通。同时大多数国家与北非和中部非洲的航班还是正常的。

疫情存在继续外溢的可能性。

3.由于阳性病例测序比例不高,除了比利时外,疫情可能已经进入其他欧美国家。由于欧美之间航班一直正常,可能存在交叉扩散的可能。

4.一旦有一两个病例泄漏(例如冷链院感、隔离点、医院交叉感染等),就可能造成本地传播。

5.多数国家没有疫情清零的实操经验,一旦Omicron开始本地传播,当地能清零的可能性不高。

6.所以,除非有极强的决心、学习能力和执行力,Omicron扩散全球的结果已经很难改变了。

三、对疫苗的影响1.疫苗需要重新改进

流行病防范创新联盟CEPI首席执行官Richard Hatchett博士说:

"一种新的SARS-CoV-2变体B.1.1.529的出现凸显了继续研究和开发COVID-19疫苗的迫切需要。

"当然,至关重要的是,我们继续在全球范围内让人们接种疫苗,以减少病毒的传播量,但我们还必须将精力和资源集中在改进当前的COVID-19疫苗上,使其更有效地对抗SARS-CoV-2的多种变体。[5]

2.改进需要时间

疫苗的研发、临床试验、大规模生产、分发、接种都要时间,整个流程所花费的时间最少也要好几个月。

3.如果确认该毒株可以完全绕过现有疫苗的防线,则“共存”国家等于不设防

可参照2020年的第一波疫情,当时没有疫苗,虽然感染人数(蓝色)不是很高,但由于重症率高导致医疗饱和,死亡人数(红色)可观。

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所以现在只能赌Omicron的致死率不高。

四、突变毒株对“动态清零”国家整体影响有限,国内不必恐慌1.防疫三要素并不依赖疫苗

国内一直动态清零,能看到的病例都和外来输入有关。

如果Omicron在境外占据主导地位,输入我国是迟早的事情。但对变异毒株来说,公共卫生手段整体上受毒株更替影响不大。

只要能做到“控制传染源”、“切断传播途径”、“保护易感者”的任意一条,疫情就无法传播。

即使疫苗效果受到很大影响,也只影响“保护易感者”这一条。做好筛查和隔离工作,就不会影响我国防疫大局。

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我国有充足的时间研发新的疫苗。

2.需要关注新毒株的代际间隔和传播速度

从今年广州疫情的情况看,德尔塔打了我国一个措手不及:

原有的新冠肺炎病毒代际间隔为5.7天[9],R0为3.77,而德尔塔的代际间隔最短为2天[10],R0高达6。

广州疾控中心副主任张周斌在5月31日下午举行的疫情新闻发布会上表示,传播速度快、潜伏期短、病毒载量高是广州本轮疫情表现出来的三个特点,这与以往广州所经历的境外输入疫情完全不同,三个特点都加速了病毒代际传播的速度,三者叠加的效应也使得广州本轮疫情加速发展。[11]

如果Omicron传播更快,就要求我国防控体系更快的响应速度、各地防疫部门之间更快的信息流通速度。

建议进一步精细化调整新冠肺炎疫情分区分级标准,建立全国统一流调信息平台

2021年11月中旬,西北疫情多日没有新病例,接近结束,本次疫情防控暴露哪些问题?哪些方面需要改进?14 赞同 · 11 评论回答15 赞同 · 11 评论回答5003.需要关注重症率

如果症状出现变化,就要考虑更新《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》

如果重症率更高,则需要准备更多的医疗资源。

五、关注疫情输入风险点,防止本土疫情再次爆发

1.海关

东部地区管理较好,中西部陆路口岸风险较大,如策克口岸。

2.传染病医院

今年8月的郑州疫情和传染病医院密切相关。本次西北疫情中,有多个省份出现了院感问题。

3.隔离点

隔离点可能发生交叉感染(莆田疫情)、工作人员感染(广州、遵义、石家庄)、周边小区或者村庄感染(广州、成都)。

例如:

此前,据福建省莆田市仙游县应对新冠肺炎疫情工作指挥部办公室9月10日通报,经专家研判,本次疫情源头疑似为新加坡入境人员林某杰导致的传染链条。9月16日的发布会上,有记者提问,根据媒体报道,在福建发生的聚集性疫情中,有病例是在隔离期间多次核酸检测均为阴性,21天解除隔离后,转为阳性,请问该如何理解这一现象?中国疾控中心免疫规划首席专家王华庆表示,目前根据流行病学调查,还有抗体水平检测,尤其是根据基因测序的比对分析,该名病例有非常大可能性是在隔离期间感染上的,从而导致了后续疫情的发生。
莆田疫情疑似源头,或在隔离期间感染baijiahao.baidu.com/s?id=1711220056790685258baijiahao.baidu.com/s?id=1711220056790685258500

4.冷链

大连冷链产生的疫情已经至少有3次了,本次也不大可能是最后一次。[12]

5.来自境外的快递

继11月9日内蒙古自治区锡林郭勒盟正蓝旗牧民购买的蒙古袍核酸检测呈阳性后,10日,锡林郭勒盟苏尼特左旗又有1位牧民购买的靴子核酸检测呈阳性。蒙古袍、靴子均系从此前锡林浩特市通报部分货品核酸筛查呈阳性的服装店所购买。11月7日,锡林浩特市扎贺雅民族服装店店主报告,他从蒙古国购置了4批次货品。经疾控中心检测,直接接触人员核酸检测呈阴性,部分货品核酸筛查呈阳性。同日,苏尼特左旗牧民从该店网购了1双靴子。11月9日,苏尼特左旗疾控中心人员对快递进行拆封、采样、消杀。经核酸检测,靴子表面检测结果呈阳性,快递外包装核酸检测结果呈阴性,无直接接触人。11月9日,正蓝旗新冠疫情防控工作指挥部在对扎贺雅民族服装店有关人员进行排查时发现,该旗上都镇1位居民于10月26日通过顺丰快递收到该店邮寄的蒙古袍核酸检测呈阳性,直接接触人员核酸检测结果呈阴性。连日来,锡林郭勒盟多地从蒙古国代购的部分商品核酸结果呈阳性。11月4日,5位二连浩特市民从蒙古国代购的商品经检测,部分商品呈阳性。11月8日,东乌珠穆沁旗疾控中心在佰户会展中心呼伦贝尔苏德格日勒民族服饰商品分店对蒙古国进口衣物核酸检测筛查中,2批次部分衣物核酸检测呈阳性,直接接触人员核酸检测结果呈阴性。[13]

6.隔离14天后检测阳性的人员

广西贵港也发现一例解除隔离后出现阳性的病例:

广西贵港市关于一名入境解除隔离返贵人员确诊为无症状感染者的情况通报2021年11月19日,我市在隔离点对入境解除隔离返贵人员罗某某进行例行新冠病毒核酸检测中检出可疑阳性,当天再次重新采样后,由市疾控中心、市人民医院、港南区疾控中心新冠病毒核酸检测结果均为阴性。罗某某无发热、咳嗽等临床症状,两肺未见明确病毒性感染征象。11月20日第三次采样检测结果为弱阳性。综合核酸检测和临床症状,诊断为新冠肺炎无症状感染者。现将其活动轨迹公布如下:2021年11月3日—17日11月3日从尼日利亚中转德国法兰克福,在辽宁省沈阳市入境(一同返贵人员共4人),由专车转运至辽宁省沈阳市集中隔离点隔离14天。2021年11月18日乘坐专车从集中隔离场所转运至沈阳桃仙国际机场,9时35分乘坐QW6025航班(座位号27A),中间经停温州机场,16时30分抵达南宁吴圩机场。约17时10分乘坐网约车前往南宁东站,18时40分从南宁东站搭乘D3641动车至贵港站(车厢07车,座位号14C),上车后除吃泡面、喝水外,其余时间全程佩戴口罩,未与他人交谈。约19时22分到站,从A出口出站,被贵港高铁旅客管理专班排查发现是入境人员,经核查行程卡、身份证、在沈解除隔离证明等材料之后,通知辖区县级疫情防控指挥部安排车辆进行点对点转运,并引导其在A出站口前方空地等候,于21时许从贵港高铁站闭环转运至港南区集中隔离医学观察点进行医学观察(与其同行返贵的其他3名入境人员均第一时间纳入集中隔离医学观察点管控)。

我国入境人员普遍要隔离21天,可考虑将21天集中在入境地点完成。

如果某个口岸航班量太高无法隔离这么多人,可以考虑重新安排航班入境点,分流过多的航班。

六、只有全国所有地区的疾控部门对境外疫情动向保持密切关注,并做好各方面的准备,才能避免被新毒株打得措手不及参考^https://www.ft.com/content/d42bcd3d-e70d-4e97-818b-40b92d89d7ff^https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxODI3NzY1Mg==&mid=2247485898&idx=1&sn=bb94e86461697c52eeb36d4f50075234&chksm=c1b292b1f6c51ba717ffa4be4f94bcbb2e82a4bd09e32d74ec05b87ca18b7b2c502efd7e7978&token=2137540018&lang=zh_CN#rd^https://twitter.com/DrEricDing/status/1464119235655970819^https://www.youtube.com/watch?v=jwDMI0nOnAY^abchttps://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-b-1-1-529-variant-situation-in-south-africa-and-news-that-travellers-arriving-in-the-uk-from-several-southern-african-countries-will-have-to-quarantine-and-from-1200-uk-time-on-t/^https://m.gmw.cn/2021-11/27/content_1302696183.htm^https://t.ynet.cn/baijia/31791602.html^http://news.carnoc.com/list/573/573767.html^https://zhuanlan.zhihu.com/p/372965045^https://news.sina.com.cn/c/2021-06-01/doc-ikmyaawc8783978.shtml^http://news.yunnan.cn/system/2021/06/01/031486091.shtml^https://www.163.com/dy/article/GP6KVIPN0523H9J0.html^https://xw.qq.com/cmsid/20211112A000XO00编辑于 11-27 15:56

B.1.1.529 毒株被 WHO 紧急列为「需担忧变种」并命名为 Omicron,这意味着什么? - 知乎  https://www.zhihu.com/question/501882515/answer/2245024673

2021-11-27
国际 社会 健康

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